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はてなキーワード: ゲノムとは

2021-02-10

anond:20210210200847

言うてそれでなんか問題あるかみたいな気持ちはあるわ

ゲノム情報国に取られたところで捕まるようなことはしてないし

2021-01-23

anond:20210123175913

遠い将来にはヒトゲノムからヒトを培養できるようになるのかな

2021-01-07

PCR検査理解する(IT系)

日本人PCR検査について、どうも間違った知識の方が未だに多いと思われる。

(高名な感染症医が間違った事を言って、訂正していないため)

自分理解プログラム等で例えて書いてみる。

PCR本質

PCR検査は解析で分かってるゲノム配列との「部分一致」で判定する。

以下等に新型コロナ配列は公開されている。

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_045512

配列が一致した時だけピカーと光る薬剤を混ぜて、温めるだけ。

温めるとウイルスが増幅されて、より光る反応が増える。

何回かループ(40回など)を繰り返して、光の反応の増え方で判定する。


rubyで書くとこんな感じと思われる。

(謎の文字列が新型コロナゲノム配列

for i in 0 .. 40
  if input =~ /LVATAEAELAKNVSLDNVLSTFISAARQGFV/
    flag = 陽性
  else
    flag = 陰性
  end
end

ここで重要なのは、(部分)一致判定という事。

まりウイルス存在するか?」なだけの2値的な判定。

ゲノム配列は初期の中国製薬剤には他のウイルスに反応するものもあったが、

今は100%コロナウイルスしか反応しない。


PCRの判定自体採取は除く)は特異度、感度共に100%と(日本以外では)されており、

ウイルスがある事」を確実に判定できる検査

こういった原理から考えると、検査精度的な偽陽性は発生しない事がわかると思う。

ウイルスがいないと反応するわけがないため)

検体採取だけの問題で、ウイルスが上手く取れれば100%反応するし、取れないときは反応しない。

偽陽性偽陰性

日本問題


https://www.huhp.hokudai.ac.jp/news/2020-09-29/

2020-12-29

anond:20201228224904

科学的で合理的食事が普及した未来より人間ゲノム編集してバフェット並みに頑丈な人類だらけになった未来が来て欲しいわ。

2020-12-20

英国では最初の1週間で13万8千人が接種を受けた。

14日から接種が始まった米国

カナダなどでも接種を開始。

ロシア中国では独自に開発したワクチン市民への接種が始まっている。

中国のチームが新型コロナウイルスゲノム配列を発表したのが1月

そこから1年足らずで、複数ワクチン実用化にこぎつけようとしている。

過去実用化まで最速だったワクチンおたふく風邪とされるが、それでも4年を要している。

そのスピード世界が驚いている。



そのころ、日本では、5人以上の会食が禁止なら、6人家族はどうすべきかで揉めていた。

2020-12-08

……恋なんていわばエゴエゴシーソーゲーム……とか言う……歌詞に対しても昔……エコとヒトゲノム……とか言っちゃってたような気が……

2020-10-28

anond:20201028105809

ASD発症率の親の年齢との関係は、父親母親のどちらの年齢が高くてもリスクが上昇して、逆相関は、高年齢の父親と若年齢の母親、弱年齢の父親と高年齢の母親のどちらでもみられていたと思います

また、エピゲノムマーカーの変化は、ゲノム状態を変化していることを示しており、ASDリスクを直接説明するものではないと思います

ASD発症リスク精子限定したような書き方に見えたので質問してしまいました

ご回答ありがとうございました

2020-10-20

anond:20201019012408

おもしろそうなので日記を書いてみる

共感性とはなにか

教官(エンパシー(empathy)とは、他者感情を想定し共有すること

疾患との関連

自閉症アスペルガーサイコパス共感性の低さに関連があると考えられている

共感性の測定と定量

Emotional Intelligence (EI)を測定するテスト(EITest)によって、定量化を行えるらしい

個人

老人と女性共感性が他のグループに比べて共感性が高いみたい

共感はどうやって生まれるか

ミラーニューロンシステムバソプレシンオキシトシンシステムあやしいらしい

ミラーニューロン

ミラーニューロン自分他者の行動の両方で活動する神経細胞霊長類は持っているみたい

自閉症ではミラーニューロン機能不全が見られるらしい

バソプレシンオキシトシン

脳内情報伝達物質で、養育、求愛きずな形成に関与するらしい

男女で働き方が違うらしいという話もあり

オキシトシンミラーニューロン活動を上げることができる

共感遺伝するか

ある程度は遺伝する模様

遺伝子と共感関係いろいろ

複数人ゲノムデータ(ただしゲノムの一部で全体ではない)とEQの関連性を調べて、関連のある場所を探すといくつかの遺伝子がみつかった

いくつかの共感関係する遺伝子を変異させた動物の行動をみると共感性がおかしくなる

共感関係しそうな遺伝子の周辺の個人差は共感性を相関がみられる

2020-10-13

ノーベル賞」を表す漢字を作ろう

オリンピック五輪、みたいに。

ネットニュース見出しは大体15文字以下で、そのうち7〜8文字が「ノーベル[部門名]賞」で埋まってしまう。

残りの文字数では、重要情報である人物名か国籍」「受賞内容」のうち片方しか書けない。

そこで、「[部門名]賞」の前に付けることでノーベル賞の意味になるような漢字を作ることを提案する。

これにより「〇化学賞 英仏2氏 ゲノム開発」のように、見出し内に人物と内容の両方を書ける。

何の漢字がいいだろう。

2020-10-10

ゲノム編集って赤ちゃんしか効果ないの?

成熟しきってしまったKKOの醜い顔はゲノム編集をもってしても修復できないの?😜

2020-09-20

anond:20200920053748

分子栄養学研究室では、栄養素や食品成分の生理作用について、個体レベル分子レベル、並びに遺伝子レベル理解することを重点おいて教育研究を行っています

近年、食の欧米化に伴い肥満糖尿病、癌などが増加しており、大きな社会問題となっています。当研究室では、これらの疾病を予防する栄養素や食品成分に着目し、それらの作用メカニズムを解明することを目的として研究を行っています

ヒトゲノム解読が終了した今日、疾患発症食品機能遺伝子レベルで解明されようとしています。当研究室では、肥満など生活習慣病発症や進行のメカニズムについて、培養細胞網羅的な遺伝子解析、トランスジェニックマウスやノックアウトマウスなどを利用した動物実験を通じて解明に取り組んでいます。これらの研究成果を通して、生活習慣病などの疾病予防の標的分子見出し食品機能評価機能食品の開発への応用を目指しています

https://www.hiroshima-u.ac.jp/gsbs/graduateschool/seibutsukino/bunshieiyou


↑真面目な分子栄養

↓怪しい分子栄養


 オーソモレキュラ栄養療法(orthomolecular medicine)は、我が国では「栄養療法」「分子栄養学」「分子整合栄養医学」とも称され、栄養素-適切な食事サプリメント・点滴、糖質コントロール-を用いて、わたしたち身体構成する約60兆個の細胞のはたらきを向上させて、様々な病気を治す療法です。

https://www.orthomolecular.jp/message/

2020-08-25

命を守るために!ゲノム機械学習大事なの!

 ↓

エンジニアの命も守ろうよ。

2020-07-30

ループから増田を分けるよ anond:20200730133633

元増田とかの内容を「増田で見られる謎のルッキズム」って勝手定義して話をしてたわけね、共有されてないお前の中の前提を話すならそのことをちゃんと言わないと相手には伝わらんぞ。

最初から共有してるぞ

ルッキズム本質的人種差別からね。

増田でよく見られる「単なる醜形恐怖症」とか 「学歴コンプ」と 言い換えられる謎のルッキズムとは違う

 

残念ながら、現在赤ちゃん研究でもまだ言語を持たない赤ん坊が “自分と同じ人種優遇” するって結果が出てたりする

 

[Frontiers in Psychology] I“I pick you”: the impact of fairness and race on infants’ selection of social partners

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpsyg.2014.00093/full

 

なので意識して多様な美なんだよ?

MARCH じゃないか人権が無いとかそういう話じゃないよ?

 

印象管理操作必要なのはルッキズム」があるからだろ、ルッキズムがないなら化粧やアクセサリー服装なんかでの印象管理操作必要ないだろ。

 

これも同じ話の繰り返しになるね。増田のいう謎のルッキズム生存に関わる話ではなく、ビジネスで得するにはとかそういうレベルの話、“印象管理操作” の分野の話

増田人生にそれが必要ならすればいいし、不要ならしなければいい。誰も増田強制はしていない

そして、下記は明確にYESだね。生存ではなくビジネスで得しようのレベルの話なら “印象管理操作” の分野の話

障害者認定ウケるレベルの不利とされるレベルの人以外には、見た目による影響は皆無だって主張なの?

面倒だから以下コピペ

現実には日本人集団自然淘汰されている外見(遺伝)特徴があり、

現存しているのは生存に不利になる外見(遺伝)特徴ではないと考えるのが

フツーじゃないかと思うけどね

なによりそれが本当に最優先されるならそうじゃない個体自然淘汰されているはずだが

されてないでしょ? 

 

ちなみに身長に関しては日本人集団では自然淘汰が働いていたようだよ

日本人約19万人の身長に関わる遺伝的要因を「ゲノムワイド関連解析(GWAS)[3]」により調べた結果、573の遺伝変異を同定しました。

また、身長に影響するSLC27A3とCYP26B1という二つの遺伝子を新たに特定しました。

さらに、低頻度の遺伝変異身長を高くさせる傾向にあることを明らかにしました。

 

これは、身長を高くする遺伝変異日本人集団では自然淘汰を受けていたことを示唆する結果で、
欧米人検証された結果と真逆であり、高身長日本人にとって何らかの不利な影響を及ぼしていた可能性を示しています


理化学研究所

https://www.riken.jp/press/2019/20191002_1/index.html

anond:20200730121618

ワイが言ってるのは、「増田で見られる謎のルッキズム」と「印象管理操作」 は違うという常識的な話やね

 

そして、下記は明確にYESだね。生存ではなくビジネスで得しようのレベルの話なら “印象管理操作” の分野の話

障害者認定ウケるレベルの不利とされるレベルの人以外には、見た目による影響は皆無だって主張なの?

面倒だから以下コピペ

現実には日本人集団自然淘汰されている外見(遺伝)特徴があり、

現存しているのは生存に不利になる外見(遺伝)特徴ではないと考えるのが

フツーじゃないかと思うけどね

なによりそれが本当に最優先されるならそうじゃない個体自然淘汰されているはずだが

されてないでしょ? 

 

ちなみに身長に関しては日本人集団では自然淘汰が働いていたようだよ

日本人約19万人の身長に関わる遺伝的要因を「ゲノムワイド関連解析(GWAS)[3]」により調べた結果、573の遺伝変異を同定しました。

また、身長に影響するSLC27A3とCYP26B1という二つの遺伝子を新たに特定しました。

さらに、低頻度の遺伝変異身長を高くさせる傾向にあることを明らかにしました。

 

これは、身長を高くする遺伝変異日本人集団では自然淘汰を受けていたことを示唆する結果で、
欧米人検証された結果と真逆であり、高身長日本人にとって何らかの不利な影響を及ぼしていた可能性を示しています


理化学研究所

https://www.riken.jp/press/2019/20191002_1/index.html

増田で見られる謎のルッキズムについて

じゃあお前が世の中にはルッキズム差別はないって主張してるわけかw

ルッキズム本質的人種差別からね。

増田でよく見られる「単なる醜形恐怖症」とか 「学歴コンプ」と 言い換えられる謎のルッキズムとは違う

 

インド然り、北欧然り、アメリカ然り、人種が行き交い血が混ざり合うさまざまな地域で発生しがち

ボーダーの感想文追記でも書いたけど

化け物として描かれてがちなのは大抵混血によって発生し得る容姿なのよね

過去、ダウン顔は Mongoloid (黄色人種蒙古人種) の顔と定義した(Mongolism:蒙古症) 西洋医学者もなんなんだ?って話だけど、

 

残念ながら、現在赤ちゃん研究でもまだ言語を持たない赤ん坊が “自分と同じ人種優遇” するって結果が出てたりする

[Frontiers in Psychology] I“I pick you”: the impact of fairness and race on infants’ selection of social partners

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpsyg.2014.00093/full

 

なので意識して多様な美なんだよ?

MARCHじゃないか人権が無いとかそういう話じゃないよ?

 

しかし、同族(同じ人種・同じ集団)として認められる外見ではあったとしても、

同族の中で損得は発生するよね?って言ったら、もちろんその通り

 

学歴は無いよりあったほうがいいし、早慶上智以上であるならそれに越した事はないね

けど、フツーの人は越した事がないだけで終わり

泣いて暮らしたり、歯軋りで歯をすり減らしたり、人権がないって発狂したりはしない

 

なによりそれが本当に最優先されるならそうじゃない個体自然淘汰されているはずだが

されてないでしょ? 

 

ちなみに身長に関しては日本人集団では自然淘汰が働いていたようだよ

日本人約19万人の身長に関わる遺伝的要因を「ゲノムワイド関連解析(GWAS)[3]」により調べた結果、573の遺伝変異を同定しました。

また、身長に影響するSLC27A3とCYP26B1という二つの遺伝子を新たに特定しました。

さらに、低頻度の遺伝変異身長を高くさせる傾向にあることを明らかにしました。

 

これは、身長を高くする遺伝変異日本人集団では自然淘汰を受けていたことを示唆する結果で、
欧米人検証された結果と真逆であり、高身長日本人にとって何らかの不利な影響を及ぼしていた可能性を示しています


理化学研究所

https://www.riken.jp/press/2019/20191002_1/index.html

 

このトラバ増田で見られる謎のルッキズムに付けています

anond:20200730103920

2020-07-29

anond:20200729111245

シンプルな話でそれを最重要優先項目に設定していなかったからだよ

殆どの人にとって学歴と同じ。あればあるに越したことない程度で

枕を涙に濡らしたり、歯軋りしたり、発狂するほどのことではない

 

なお、身長に関しては日本人集団では自然淘汰が働いていたようだよ

日本人約19万人の身長に関わる遺伝的要因を「ゲノムワイド関連解析(GWAS)[3]」により調べた結果、573の遺伝変異を同定しました。

また、身長に影響するSLC27A3とCYP26B1という二つの遺伝子を新たに特定しました。

さらに、低頻度の遺伝変異身長を高くさせる傾向にあることを明らかにしました。

 

これは、身長を高くする遺伝変異日本人集団では自然淘汰を受けていたことを示唆する結果で、
欧米人検証された結果と真逆であり、高身長日本人にとって何らかの不利な影響を及ぼしていた可能性を示しています


理化学研究所

https://www.riken.jp/press/2019/20191002_1/index.html

2020-07-15

anond:20200715121305

コロナロックダウン病気が治らなきゃ町ごと焼却 ゲノム社だっけ?

バイオ事故おれ 村からそとに

おま

・・・

2020-06-27

anond:20200627113928

ワイも身長180くらいは欲しかったわはともかく、

フツーに身長に関わる遺伝子とその遺伝子が発現したかどうかやろな

遺伝子 身長検索するといっぱい出てくるで

なお、ホビット一族なワイは正しい日本人な模様

日本人約19万人の身長に関わる遺伝的要因を「ゲノムワイド関連解析(GWAS)[3]」により調べた結果、573の遺伝変異を同定しました。また、身長に影響するSLC27A3とCYP26B1という二つの遺伝子を新たに特定しました。さらに、低頻度の遺伝変異身長を高くさせる傾向にあることを明らかにしました。これは、身長を高くする遺伝変異日本人集団では自然淘汰を受けていたことを示唆する結果で、欧米人検証された結果と真逆であり、高身長日本人にとって何らかの不利な影響を及ぼしていた可能性を示しています


理化学研究所

https://www.riken.jp/press/2019/20191002_1/index.html

2020-06-23

「唯一生き残ることが出来るのは変化できる者」ってことは、つまりゲノム編集だな・・・

2020-04-22

個人でのPCR検査キットの使用は控えましょう」だと?

感染症医の先生が書いてるこの記事だが

https://news.yahoo.co.jp/byline/kutsunasatoshi/20200422-00174556/

 

考え方がおかしいだろと言いたい。

楽天PCR医者が言うべきなのは素人採取だと検体取れない事が多いのでそこを理解して」って事じゃないの?

 

特に文句があるのがPCRカジュアル化に難を示している事だ。

今回の危機ボトルネックになってるのがPCRキャパで、それって「使われないと市場が拡大しない」のだが。

高い機械を買って温存しておくって方式だとその機械を買った会社はどうやって購入費を回収するの?

アメリカじゃ素人採取PCRを受け付ける会社が沢山存在し、料金も3000円とか5000円とかリーズナブルだ。

それで国内に受けてくれる検査会社が少ない、若しくは無い獣医はそういうのを頼ってペット病気診断をしている。

もしこの先生PCRカジュアル化に反対するなら今後診療特に意味がなくてもPCR検査を湯水のように無駄遣いして欲しい。そうしないと市場が拡大せずまた次の危機で同じ轍を踏む事になるからだ。

日本医療CTが潤沢にあるがそれは自然に湧いたのでなく病院ガンガンCT使いまくり、多くの業者が参入して機械価格が下がり更新されまくった結果じゃないか。それで病院も投下資本の回収適正期間で出来る様になった。そして租税回避のために機械更新、それが市場をまた拡大する。

 

ゼロ年代経済ブログなんかに毒された人はこういう視点が皆無だ。サラリーマン給与運用視点権威付けするのが経済学と思ってる。

 

高いPCR装置を温存していたら購入費は回収できず、検査費用も高いままだ。そしてキャパは拡大しないのだ。

PCRなんてたかPCRであってカジュアル化に反対するのは害悪だ。

 

特異度99.9%と偽陽性0.1%もあるとしているのも謎だ。そんなに偽陽性高いの?PCRで?

PCRは全ゲノム読む訳じゃなくて薬剤処理の都合で飛び飛びに増幅させる。これはコンピュータファイルハッシュ取るのに似てる。

ハッシュ取ってそれが他のファイルハッシュ合致するなんてあり得る?無理がある措定にしか見えない。

 

>検体の採取経験のある医療従事者が行うべき

と章が割かれているが、そんな厳格に資格を狭めていたらこ危機収束できません。自衛隊員一般公務員などが訓練して従事するようになるでしょう。「素人は失敗して無駄になるケースが多い」と警告すれば十分です。

この先、日本自力収束できず、台湾韓国の力を借りる事になるだろうが、その時派遣される検査人員医者ではないだろう。

 

楽天PCRキットは問題がある。だがそれは

 

素人採取から検体取れない事が多い

・検体提出機関が恐らく外国。だから国内PCR検査市場拡大に資さない。

・高い。単価5000円以下を目指せ

検査会社の素性や信頼性がはっきりしない

 

というところであって、検査結果が医療根拠にならないのは医療用として認可されていないのだから当然。トートロジーだな。

それより大事なのはこの危機の間にもPCRキャパ拡大は急務だし、事後も保険としてPCPRキャパは大幅に拡大しておく必要がある。何しろこれは経済的損失も戦争レベルPCR装置の購入費なんてミサイル一発レベルだ。その為には通常から検査会社試薬会社が食べれるように市場を回しておく必要がある。

無駄遣いは市場を育てる。価格を低減させる。そしていくら無駄遣いしても額が並ぶ事も無いほどの損害が出ていて、今感染爆発中なのかマイルドカーブなのかも見当が付かない状態なのだ

から先生には「楽天PCRはね~」と言うよりも、「楽天PCRみたいなインチキかよー判らん商法意味がなくなるようにCTと同じように通常からPCR使いまくって沢山市場に整備して危機に備えられるようにしよう」と提言して欲しいのだ。

感染症先生や装備は社会保険なのだ

anond:20200421222352

神が作ったとかいうそういうファンタジーの話じゃなくて

中間種がゲノム存在しないっていう科学的根拠があるから

神じゃないとしてではどうやって新種が発生したのかは依然謎のままなのに進化論絶対に正しいという論調危険って話

いまだに進化論こそが正解だという認識しかしてないのは先進国として遅れてる

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