宮崎駿は手塚治虫から多大な影響を受けた。
　宮崎駿は少年時代に、手塚治虫のデビュー長編「新宝島」に衝撃を受け多大な影響を受けたという。
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宮崎駿の若い頃
「新宝島」、当時４ページ程度だった漫画というジャンルを２００ページを超えるボリュームで制作され、４０万部のベストセラーとなった。
新宝島手塚治虫文庫全集
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作者:手塚治虫
講談社
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　漫画家を目指していた宮崎駿は、自身が受けた手塚治虫の影響について、こう語っている。
手塚治虫の持つ悲劇性が魅力的だった。
小中学生の頃のぼくは、まんがの中では彼の作品が一番すきでした。昭和２０年代、単行本時代ー最初のアトムの頃ーの彼のまんがが持っていた悲劇性は、子ども心にもゾクゾクするほど怖くて魅力がありました。ロックも、アトムも、基本的に悲劇性を下敷きにしていたでしょう。
漫画を描き始め、手塚の影響からいかに逃れるかが重荷だった
１８才を過ぎて自分でまんがを描かなくてはいけないと思ったときに、自分にしみ込んでいる手塚さんの影響どどうやってこそぎ落とすが、ということが大変な重荷になりました。（COMIC BOX 手塚治虫特集インタビューより）
ぼくは全然真似した覚えはないし実際似ていないんだけど、描いたものが手塚さんに似てると言われました。それは非常に屈辱感があったんです。手塚さんに似ていると自分でも認めざるを得なかった時、箪笥の引き出しにいっぱいにためてあったらくがきを全部燃やしたりした。（COMIC BOX 手塚治虫特集インタビューより）
「風の谷のナウシカ」漫画版も手塚の影響下にある
庵野秀明が宮崎駿の最高傑作と呼ぶ「風の谷のナウシカ」漫画版でも、手塚の影響があるのだという。
風の谷のナウシカ全7巻箱入りセット「トルメキア戦役バージョン」
風の谷のナウシカ全7巻箱入りセット「トルメキア戦役バージョン」
作者:宮崎駿
徳間書店
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──だけどまあ、『ナウシカ』を観れば、そのスキルたるや、すさまじいですよね。
宮崎：いやいや、そんなことないです。やっぱり僕自身、アニメーションをやる前に手塚さんの影響下にいてね。そこからどうやって抜け出すかっていうので、にっちもさっちもいかなかったっていう、その影がね、いまだに『ナウシカ』の中にありますよ。だから、自分で見てて嫌になるんですよね。結局、そこらへんをほったらかしにしてアニメーションをやってたから。だからいざ漫画を描くとね、手塚さんとは全然違うように見えるかもしれないけども、やっぱり手塚さんの背負ってた時代的な制約みたいなものが、僕の世代の制約としてちゃんと影を落としてると思いますね、例えば、女の子の描き方とかね。今の連中のほうがずっと自由に描いてますよね。それはものすごく感じます。（風の帰る場所ナウシカから千尋までより）
手塚治虫は、宮崎駿の才能に嫉妬
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手塚治虫
　
宮崎駿に嫉妬し、「ナウシカ」の手塚賞受賞に反対！？
　方や、手塚治虫は宮崎駿の才能に嫉妬していたのだという。手塚賞の大賞に漫画版「風の谷のナウシカ」が選考の中で、推されたているも、嫉妬した手塚治虫の一言で選考がひっくり返った際のエピソードをジブリプロデューサー鈴木敏夫が語っている。
　当時、選考委員より鈴木のもとに電話があり、「宮崎駿さんは、受賞を受けてくれるだろうか？」と言われたのだという。鈴木が、「多分、大丈夫でしょう」と返すと、選考委員は、「ありがとうございます。今、選考委員の中で決まっているんですが、手塚先生が遅れて参加するので、最後、手塚先生の確認だけとって、正式なご連絡をします」とのこと。
　その日の深夜、鈴木のもとに選考委員より気まずそうに電話があり、「手塚先生がナウシカの受賞に反対された」と言われたのだという。手塚の反対意見の内容を、鈴木はラジオでこう語っている。
手塚：宮崎君が描かれたものだから、大変素晴らしい。僕もちゃんと読んでますし、漫画賞にふさわしい。だけど、まだ完結してないですよね！？残念ですね！漫画賞には、完結しないと。（鈴木敏夫のジブリ汗まみれより）
　だが、漫画賞は、完結しているもので賞をもらったものはこれまでもなかったのだという（笑）完全に、手塚治虫の嫉妬である。
鈴木：手塚さんは、当時から宮崎駿のことをよく知ってたんですよね。だから、宮さんのことをライバルと見なしたんでしょうね。あの人の負けず嫌い？面白かったですね。
手塚は自分が総監督になり、宮崎駿とアニメをつくろうとした！？
　また、鈴木は、手塚治虫が総監督となり、宮崎とアニメをつくろうとしたというエピソードも明かしている。
　「カリオストロの城」公開前、才能があるのに、なかなか、世の中に受け入れられていない宮崎駿にどうしても映画を撮らせたいプロデューサー（鈴木ではない）が、手塚治虫に相談に行ったのだという。すると、手塚は
手塚：あぁ～宮崎君というのは、素晴らしい！僕もぜひ応援したい！（宮崎が映画化する企画について）ああ！あれを映画にするのか！僕も良く知っているよ。じゃあ、君がプロデューサーで、宮崎君が監督だ。わかりました！では、私が総監督をやりましょう！（鈴木敏夫のジブリ汗まみれより）
後に宮崎は、手塚のアニメーションや悲劇性を全否定
　そんな、「新宝島」にとんでもない影響を受けたと語る宮崎駿だが、手塚のアニメーションの仕事にはかなり否定的である。
アニメーションに関して、手塚さんが主張したことは全て間違い
アニメーションに関してはーこれだけはぼくが言う権利と幾ばくかの義務があると思うので言いますががーこれまで手塚さんが喋ってきたこととか主張したことというのは、みんな間違いです。（COMIC BOX 手塚治虫特集インタビューより）
一時、彼が「これからはリミテッドのアニメーションだ。三コマがいい三コマがいい」とさかんに言っていましたが、リミテッド・アニメーションは三コマという意味ではないですし、その後言を翻して「やっぱりフルアニメーションだ」とあちこちで喋るに至って、フルアニメーションの意味を知らずに言っているんだと思ってみていました。同じようにロートスコープをあわてて買い込んだ時にも、もう僕らは失笑しただけです。（COMIC BOX 手塚治虫特集インタビューより）
自分が義太夫を習っているからと、店子を集めてムリやり聴かせる長屋の大家の落語がありますけど、手塚さんのアニメーションはそれと同じものでした（COMIC BOX 手塚治虫特集インタビューより）
後期作品の安っぽい悲劇性にうんざりした。
さらに、宮崎駿は、手塚治虫作品が持つ魅力「悲劇性」が、後期の作品では、ただの安っぽいペシミズムに成り果ててしまったと痛烈に批判している。
彼の初期のアニメを何本かみた時です。漂流している男のところに滴が一本たれ落ちる「しずく」や「人魚」という作品では、それらが持っている安っぽいペシミズムにうんざりした。かつて手塚さんがアトムの初期の頃持っていたペシミズムとは、質的に違うと思って（COMIC BOX 手塚治虫特集インタビューより）
これは先輩から聞いた話ですが、「西遊記」の製作に手塚さんが参加していた時に、挿入するエピソードとして、孫悟空の恋人の猿が悟空が帰ってみると死んでいた、という話を主張したという。けれど何故その猿が死ななくてはならないかという理由は、ないんです。ひと言「そのほうが感動するからだ」と手塚さんが言ったことを伝聞で知った時に、もうこれで手塚治虫にはお別れができると、はっきり思いました。（COMIC BOX 手塚治虫特集インタビューより）