2022-03-25

日本ゲノム解析体制についての一問答

https://b.hatena.ne.jp/entry/s/bunshun.jp/articles/-/52854

[B! COVID-19] 「SARSは8カ月足らずで収束したのに…」ノーベル賞有力候補世界的がん権威が綴った、新型コロナウイルス収束しない“本当の理由” | 文春オンライン

https://b.hatena.ne.jp/entry/4717166473141106114/comment/Knoa

記事タイトルは変えた方がいいと思うけど、最後の「残念ながら日本にはその体制がなく、ウイルスの追跡と新たな変異ウイルス確認外国まかせというお寒い状況のまま」は本当にそう→ https://anond.hatelabo.jp/20210904172323

https://b.hatena.ne.jp/entry/4717166473141106114/comment/butaniku200kg

日本を含めたほとんどの国では全ゲノム調べてるから新たな変異株の出現や流行を検出できる。がんの権威(笑)感染症サーベイランス体制をあまり知らないようだ。 https://www.tmiph.metro.tokyo.lg.jp/lb_virus/sars2ngstree/

https://b.hatena.ne.jp/entry/4717212936119216706/comment/Knoa

めちゃくちゃな杞憂かもしれませんが、全ゲノム解析の「全」の意味を取り違えているのでは・・・日本の解析数や解析率、そして何より、解析にかかる日数を世界と比べたことはありますか?

https://b.hatena.ne.jp/entry/4717219410249321794/comment/butaniku200kg

政党支持率調査は信用ならん。全国民を調べないと真実は分からない」論法自己紹介ノーベル賞受賞の山中教授ですらPCRを増やせば感染症が減らせると当初主張してたし、専門外の分野は誰もがこの程度。

「全」について、わたし杞憂だったようで(butaniku200kgさんが誤解していたわけではなかったようで)安心しました。

政党支持率調査についてのご意見も、まさにわたしもまったく同感です。特に政治家が、調査統計についての知識がないままに世論調査を軽視するような発言をしているのを聞くと、がっかりしますね。

しかしそんなbutaniku200kgさんだからこそ、ぜひ確認してほしいのですが、たとえば現時点で手に入る最新週の国内市中感染(GISAIDのデータ空港検疫を含むのでご注意ください)のゲノム解析データ(https://www.mhlw.go.jp/stf/covid-19/kokunainohasseijoukyou.html#h2_3)は、3月7日-13日の週で449件です。2月28日-3月6日の週までさかのぼっても、1758件。わたしは下記のような問題があると考えています

逆に、どうしてイギリスなど先進国が毎週何万件も解析しているのか、考えてみてください。butaniku200kgさんにとっては、壮大な無駄なのでしょうか…?

それでもなお、許容する誤差やそもそも変異比率を把握することの重要性などの点から、butaniku200kgさんと意見が食い違うことは十分ありえると思いますしかし、わたしや、厚労省も含めてさらなる拡充を訴えている人々が、どういう考えでいるかについては、(賛成せずとも)理解はしていただけるかと思います

記事への反応 -
  • 韓国は355件で22位です。日本と同レベルだとも言えるし、人口規模を考えればまぁ日本よりマシだと言ってもいいかとは思います。 中国はそもそも感染者数がめちゃくちゃ少ないのもあ...

    • 新型コロナウイルスのゲノム解析の結果を、どのくらい国際機関のデータベースに登録しているかのランキング。 そもそも感染者数が少ないに越したことはないのだが、新しい変異株が...

      • https://b.hatena.ne.jp/entry/s/bunshun.jp/articles/-/52854 [B! COVID-19] 「SARSは8カ月足らずで収束したのに…」ノーベル賞有力候補の世界的がん権威が綴った、新型コロナウイルスが収束しない“本当...

      • すげぇ!

      • 6月21日版(anond:20210621175921) から 10月11日版(anond:20211011205959) に至る記事の続き。 先週触れた都内のL452R「以外」の変異株の懸念は、いったん収まる傾向の数字が出ています。引き続き注...

        • ※ 10月18日版(anond:20211018215528)を公開しました。 6月21日版(anond:20210621175921) から 10月4日版(anond:20211004192706) に至る記事の続き。 都内のL452R「以外」の変異株が増加傾向を強めていて、新し...

          • ※ 10月11日版(anond:20211011205959)を公開しました。 6月21日版(anond:20210621175921) から 9月27日版(anond:20210927175649) に至る記事の続き。 まだ10月になって週が明けたばかりですが、緊急事態宣言が...

            • ※ 10月4日版(anond:20211004192706)を公開しました。 6月21日版(anond:20210621175921) から 9月21日版(anond:20210921181209) に至る記事の続き。 月曜と木曜が祝日だった先週は、予測より少ない感染者数に...

              • ※ 9月27日版(anond:20210927175649)を公開しました。 6月21日版(anond:20210621175921) から 9月13日版(anond:20210913183108) に至る記事の続き。月曜が祝日だったので都医学研の人流データ公開が1日遅れ、...

                • ※ 9月21日版(anond:20210921181209)を公開しました。 6月21日版(anond:20210621175921) から 9月7日版(anond:20210907173042) に至る記事の続き。 人流は微増に留まっているため、引き続き感染者数は減って...

                  • ※ 9月13日版(anond:20210913183108)を公開しました。 6月21日版(anond:20210621175921) から 8月30日版(anond:20210830174927) に至る記事の続き。今週は都医学研の人流データ公開が1日遅れたため、予測の公...

                    • ※ 9月7日版(anond:20210907173042)を公開しました。 6月21日版(anond:20210621175921) から 8月23日版(anond:20210823194721) に至る記事の続き。 先週は「検査数の増加と陽性率の減少が相殺されて、発表さ...

                      • ※ 8月30日版(anond:20210830174927)を公開しました。 6月21日版(anond:20210621175921) から 8月17日版(anond:20210817171700) に至る記事の続き。 前回の予測に書いた通り、陽性率がピークを越えて月曜の感...

                      • ブログでやれゴミ 増田で欲しいものリスト張ったゴミはお前だけだチョコレート野郎

                      • 今回乗り越えた第五波? がコロナ最大最後の波だと思っていいのかな? これ以降はワクチンの普及で抑え込めるよね?

                      • 新型コロナウイルスの偉大さと言ったら、この手の「統計学で未来の予測ができる」というと大嘘つきが可視化されたことだ。

                      • 日時 予測 結果 チャンピオンの予測 スコア差 8/10 120* 93 240 +93 8/17 120 78 75 -39 8/23 100 51 85 -15 8/30 80 41 9/6 60 9/13 50 ...

                    • 日時 予測 結果 チャンピオンの予測 スコア差 8/10 120* 93 240 +120 8/17 120 78 75 -39 8/23 100 51 85 -15 8/30 80 35 41 -39 9/7 60 9/13 50...

                    • 感染者だけでなく、死者数、重傷者数も入れて欲しい

                    • いつも興味深く拝見しております。特に予測の見せ方がわかりやすいです。これからも楽しみにしています。よろしくお願いします。

                      • 自演しなくて良いよ。 コメントが攻撃的だし、自己顕示欲が凄すぎ。

                  • うざい

                  • なんとなくだけど、パラリンピック開催が減少のきっかけになっている気がする。

                  • 人気エントリにすぐ出て消えたのか、投稿されていたことに気づかなかった。 チャンピオンが終了宣言をしたので、ここで成績を見てみよう。 日時 予測 結果 チャンピオンの予...

              • ぶっちゃけ、Kona氏としては、新たな変異株が真冬に大流行しそう とか思ってる? それとも、もうほぼほぼ終息してしまうだろうって思ってる? 可能性はどっちもあるだろうし、根...

              • 捕まってないだけの詐欺師

              • かまってちゃん Knoa 5週予測→ https://anond.hatelabo.jp/20210927175649 感染者数とブクマ数 時系列→ https://f.hatena.ne.jp/Knoa/20211001164148 散布図→ https://f.hatena.ne.jp/Knoa/20211001164154 (翌日まで増え続け...

            • 丁寧な解析と、相変わらず解りやすいページ作りで助かる。 100人切ってここいらで底打ちして上がりに転ずるのではと思っているが… ひと月かけて十人台まで低下するとお考えなのか…...

        • これ7月の予測と同じ手法で出してこうなってるんですか?その場合、なにが激減の要因? トリガーじゃなくて傾きに影響を与えた因子でいいので教えてください。

          • ありがとうございます。いただいた質問にかこつけて、どこかに書いておきたいと思っていたことをまとめる機会にさせていただきます。 これ7月の予測と同じ手法で出してこうなって...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 10月18日版(anond:20211018215528) に至る記事の続き。 宝くじの還元率は50%とされているので、買い続けても統計的には資金は半分、半分と減っていくはずです...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 10月25日版(anond:20211025181357) に至る記事の続き。※ 都医学研の人流更新が遅れたために予測を火曜に延期しましたが、都医学研が更新ミスしたのか、結局...

          • 意味ある??

            • 意味なさそう。 もう、とりあえず数入れた占いですレベルだし。

              • 意味ある?? 日記サイトで誰かに向かって「意味ある?」とかw 意味を勝手に規定すんな 何様だ ハラスメントしないと批判もできないのか 人流データの不足を問題にしたいならそ...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 11月2日版(anond:20211102165309) に至る記事の続き。都医学研の人流データの遅れで、予測も1日遅れました。 絶対数こそ減っているものの、2週連続で予測を大...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 11月9日版(anond:20211109174935) に至る記事の続き。 引き続き、予測は当てになりません。(感染者数が増えれば精度は高まるかもしれませんが、このまま増え...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 11月15日版(anond:20211115180038) に至る記事の続き。都医学研の人流データは月曜に得られず、火曜が祝日なので水曜まで待つしかないのですが、待ちすぎなの...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 11月23日版(anond:20211123165033) に至る記事の続き。※ 都医学研の人流データが遅れたので、今週も火曜に更新しました。 年末年始の予測の難しさに加えて、...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 11月30日版(anond:20211130165243) に至る記事の続き。※ 都医学研の人流データが遅れたので、今週も火曜に更新しました。 年末年始は昨年末以降の実測値を参...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 12月7日版(anond:20211207165019) に至る記事の続き。※ 都医学研の人流データの画像更新にミスがあるので、今週はAgoopの人流データのみで予測しました。 年...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 12月14日版(anond:20211214171150) に至る記事の続き。※ 都医学研の人流データが5週連続で火曜更新になっているので、今後も予測は月曜ではなく火曜更新にな...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 12月21日版(anond:20211221165559) に至る記事の続き。※ 火曜更新になると宣言した直後に都医学研が月曜に人流データを更新して気まずいですが、新年3日(月)...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 12月28日版(anond:20211228165805) に至る記事の続き。※ 都医学研の人流データがまだ出ていませんが、年末年始の都心の人流は予測には使えないため(帰省の人...

          • 6月21日版(anond:20210621175921) から 3月1日版(anond:20220301183041) に至る記事の続き。 振り返り 先週の感染者数は予測よりも上回り、予測70955 現実77001 (+9%) となりました。まだ陽性率は35%前...

          • 6月21日版(anond:20210621175921) から 3月8日版(anond:20220308172859) に至る記事の続き。※ 今回から、東京都が BA.2 の最新比率を公開する木曜に更新します。 振り返り 先週の感染者数は予測よ...

          • 6月21日版(anond:20210621175921) から 3月17日版(anond:20220317182626) に至る記事の続き。 振り返り 日曜区切りでの先週の感染者数は、予測よりも下回り、予測56691 現実53125 (-6%) となりました。...

            • 不織布マスクを洗って???そのまま???干してるのを こないだ目撃してしまった。 しかもたくさん……。 普通にいま、めちゃ安くはないけど売ってる。 洗うなら、布マスクの...

              • 不織布マスクだって、ちゃんと、漂白剤つかって洗えば使いまわせるよ。 洗うことで、目の細かさが失われるわけじゃないし。

                • 外したままの形で複数だったので、、洗ってないのかも……。 洗ったら、形整えますよね?買ったときみたいにまっすぐになってなくて そのまま顔から外したみたいな形だったので、...

            • 学術的な価値はさておき、お疲れさまでしたー。 ゆっくりしていってね。

            • お疲れさまでした。ありがとうございました🐈

            • これまで予想をありがとうございました!毎週見ていました。

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 12月28日版(anond:20211228165805) に至る記事の続き。※ 都医学研の人流データがまだ出ていませんが、年末年始の都心の人流は予測には使えないため(帰省の人...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 1月4日版(anond:20220104223956) に至る記事の続き。※ 都医学研の人流データがまだ出ていませんが、先週同様、年末年始の都心の人流は予測には使えないため(...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 1月11日版(anond:20220111172111) に至る記事の続き。 振り返り (オミクロンについては1月4日版(anond:20220104223956)にもたくさん書いてあるので、未読の方はぜひ...

          • 予測ありがとう! 全く予測できてないんだけど、説明せよ

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 1月18日版(anond:20220118182610) に至る記事の続き。 振り返り (オミクロンについては1月4日版(anond:20220104223956)にもたくさん書いてあるので、未読の方はぜひ...

          • ステルスオミクロンは怖いの?怖くないの? 予想はどっち?

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 1月25日版(anond:20220125172023) に至る記事の続き。 振り返り 先週の感染者数は予測よりも下回り、予測115312 現実102899 (-11%) となりました。ただし検査数の...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 2月1日版(anond:20220201171801) に至る記事の続き。 振り返り 先週の感染者数は予測よりも下回り、予測182592 現実126897 (-31%) となりました。ただし検査数の...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 2月8日版(anond:20220208171541) に至る記事の続き。 振り返り 先週の感染者数は予測よりも下回り、予測214197 現実110001 (-49%) となりました。ただし検査数の...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 2月15日版(anond:20220215171824) に至る記事の続き。※ 今週は都医学研の人流データの更新が遅れているのでAgoopの人流データだけで更新します。 振り返り ...

        • 6月21日版(anond:20210621175921) から 2月22日版(anond:20220222220022) に至る記事の続き。 振り返り 先週の感染者数は予測よりも下回り、予測101181 現実77992 (-23%) となりました。ただし検査不足...

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