gitとか
一番最初のルート部分を別にしてコミットしておいて、別ブランチに変えたら普通気づかれない。
エクスプローラや検索ツールでファイル名検索しても出てこない。
わざわざリポジトリのログまで探すことはないだろうけどたまたま見たときにわかることがないように、大きなリポジトリをクローンしてきてそこにいれるとかありかも。
Chromium みたいな大規模ならログ一覧をざっとスクロールしてもまずみつからないはず
ブランチ消して reflog だけに残すという手もありかも。
さらにファイルを resources.zip にまとめておいて「圧縮した」みたいなコメントだと一覧の中から目に止まらない気がする。
見られたくない人にパソコン使わせたときに、ピンポイントでリポジトリをみつけて reflog の中から見られたくないもののコミットを見つけてパス付き zipを 解凍するとかまずないでしょ。
TB単位だときつい。 vmdkに隠してパス掛けとくのが楽。