それな 紙媒体を売り物にしてる会社（印刷業とか）ならわかるが、 市役所システムがPDFのせいでWeb化が遅れたのはまちがいない

Webじゃ原本が手元にないんだからPDFの代わりにならんだろ。 同意の上で作成した文書が改ざんできない状態で手元に来ることが重要。