キャラクターというのが物語から切り離された成り立ちをもつようになったという点がポイントだよね
エヴァからハルヒまでに生み出されたルリルリとか灰原とか(ぶっちゃけ灰原は綾波的でないと思うが)そこらへんは物語の中で感情的な反応を示す存在である点で綾波レイ(本家)と同等なわけだよね
だからパロディとしてキャラクターの型を整理したっていうコンセプトから言って『涼宮ハルヒの憂鬱』における長門というのが「綾波的なキャラ」のプロトタイプであるとするのは正しいとおもう
ただ『ハルヒ』自体はキャラクターの型を整理したあとは普通に物語を展開したから長門自身もまた綾波レイ(本家)と同等なものにまで消化されていると言うべきと思うが