登録出来るのは「Ctrl+A」といったもので、 足で「Ctrl」指で「A」という使い方は出来なかった。 そんなことあるの？

右手親指で右ctrlを押すのおすすめ

小指の付け根で押せ。 http://qiita.com/RelaxTools/items/1a91b4a2a6189cb4e6d8

ショートカットしないことしか対策はない。近道にはそれなりの代償が伴うもの。

マジレスするとマウスジェスチャー。mousegesturel.ahkつかえ