WEBバックエンドのプログラムならそうなのかもしれんが PCやスマホで動くアプリ開発だとターミナルウィンドウからコマンド叩くことはほぼ皆無やで iOSアプリでCocoaPodでライブラリ入れ...

その時々でやりたいことが一番簡単にできる方法をやるだけさ GUIだろうとCLIだろうと任せろ