少なくとも現状では簡単にリストラできないので民間よりはましだと思う。専門分野によるけど、システム系はいったん民間で就職してスキルを上げてから公務員になる方が良いと思う。(ただし、その自治体の人気にもよるけど、民間からの経験者採用の倍率はかなり高いので、試験対策も重要。)
基本的に役所のシステム素人はそもそもベンダーのしゃべる言葉が分からないので、そんなにスキルが高くなくても、専門家と会話できて相手が分かるように自分たちの要望を伝えられればOK。
土木・建築・電気・機械あたりの職種だと人数が多くてそんなに寂しい思いはしないと思うけど、技術職が大事にされる職場と事務職がのさばってる職場で居心地はだいぶ違うと思われるので、情報収集とどの部署を希望するかは重要だと思う。