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はてなキーワード: シグマとは

2011-08-17

完全放置バイオロジー研究室在学中の皆様へ

自分が完全放置研究室所属していた時に知っておくと、もう少し楽だったろうなぁと思うツールを単に列挙

よって内容に偏りあり。



初心者向け便利なホームページ



プライマー設計がしたい

Prime設計について

タカラリアルタイムPCRでのプライマー設計指針を書いてくれている。

通常のPCRでも基本的にこれに従えばOK

http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.asp?unitid=U100004425

Sigma DNA Calculator

http://www.sigma-genosys.com/calc/DNACalc.asp

シグマ社が提供しているPrimerの計算ソフト

Primerの長さ、分子量、TmGC含量、2次構造の作りやすさ、Primer Dimerの有無などを複数のサンプルに対して計算してくれる。

*異なるPrimer間でのDimer形成に関してのデータは無い

設計してみた配列を入れ使えそうか考える。




知らないタンパク質が出てきた

○UniProt

http://www.uniprot.org/

タンパク質についてのデータが簡単に手に入る。知らないタンパク質名があったら取り敢えずココで検索

アミノ酸配列

・糖鎖付加部位

・S-Sの部位

・報告されている変異の場所

・関連性の高い論文へのリンク などなど多数の基本情報が記されている

○Compute pI/Mw tool

http://web.expasy.org/compute_pi/

タンパク質配列からpI値と分子量を計算してくれる。

使用頻度は低いけれど、無いと困るソフト




DNA配列からアミノ酸配列を知りたい

○Translate tool

http://web.expasy.org/translate/

DNA配列からアミノ酸配列翻訳してくれるソフト

ドンフレームがズレていても、逆向きの配列でも全てのパターン翻訳してくれる。(フレームのズレ3種×向き2種=Total6パターン)

表示も3文字表記と1文字表記があり、翻訳後のコピ-&ペーストに便利





公開されているVectorDNA配列を知りたい。

Vector Database

https://www.lablife.org/g?a=vdb

報告されている様々なベクター情報が見られるページ

配列マップも表示され、新しいベクターを作製する場合何かと便利





系統樹を描いて配列比較したい

○ClustalW2 - Multiple Sequence Alignment

http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/

系統樹を描いてくれるソフトホモログなんかを比較する時にも便利。

使い方の簡単な説明がYouTubeに載っています

http://www.youtube.com/watch?v=r2cG1SzDdBA

YouTubeでもある通り、ホームページ内でも系統樹を見る事が出来ますが、オフラインデータを見たい場合

TreeView Xを使えばできます

http://darwin.zoology.gla.ac.uk/~rpage/treeviewx/download.html




論文を読むのが苦しい人へおオススメ

アドオン(firefox)

ライフサイエンス辞書ツール

マウスオーバー単語意味が表示される。ライフサイエンスに特化しているのためマニアック単語もいける。


英辞郎 on the web

ライフサイエンス辞書ツールのようにマウスオーバーではないが、検索ボックスコピー&ペーストしなくても検索が可能なので、とても楽。

ライフサイエンスに特化していないが、かなり広い範囲の単語が登録されているのほとんどの単語、述語の意味が分かる。


検索

ライフサイエンス辞書オンラインサービス

英語共起表現

http://lsd.pharm.kyoto-u.ac.jp/ja/service/weblsd/conc.html?c

上記したライフサイエンス辞書ツールを開発しているホームページ

単語にたいしての共起表現検索してくれる。分からない単語の訳の予想や、論文を描く時の助詞検討する時に便利



とりあえずの便利ツールでした。

2010-01-14

http://anond.hatelabo.jp/20100114061551

べる数か・・・今知った。どうでもいいけど、数学って、同じことを複数の数式で表すのは良いけど、アルゴリズムにしにくいなぁw

ベル数Bのn番目を・・・Σの数学的表記がはてな記法でかけねぇ、

http://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%83%99%E3%83%AB%E6%95%B0

あたりからシグマを当てひろってもらうとすると

B(n+1)={nΣk=0}(nk)Bk={nΣk=0}nCk・Bk={nΣk=0}n!/((n-k)!k!)・Bk

ってことで

多倍長のクラスをCint として

cint factorial(int n){
 cint r = cint(1);
 for(int i = 1 ; i <= n ; i++){
  r*=i;
 }
 return r;
}

cint bell(int n){
 n--;
 if(n==0){
   return cint(0);
 }
 cint r = cint(0);
 for(int k=0 ; k <= n ; k++){
    r+=factorial(n)/(factorial(n-k)*factorial(k))*bell(k)
 }
 return r;
}

こんな感じか?

というか(n k )縦書き とかnCk とか n!/((n-k)!k!) とか、よくわかりません。orz

で、どうやって検算するんだ?

だれか、制度の良い多倍長クラスたのむ。

2009-09-01

http://anond.hatelabo.jp/20090901215617

シグマプロジェクトですか。

そこを指摘されておとなしくなるとは錚々たるメンバーですね。

2009-05-21

http://anond.hatelabo.jp/20090521213055

甘い。

すでに現実になっているらしいよ。

兄弟姉妹で、

オメガ泰造、ミュウ華子ベータ隆夫、シグマ智一、パイ龍之介

だってさーwwww

2009-02-14

中一ギャップより高一ギャップ

よく中学校に入ると突然勉強についていけなくなって落ちこぼれるって話聞くけど、それ本当? 俺の周りでは全然聞かないんだけど。

中学受験しない限り、周りのレベル小学校の時と同じなんだから、相対的な成績は変わるわけないじゃん。勉強内容だって小学校で既に習ったことの繰り返しだし。数学でいえば、小学校で習った四則演算を、負の数入れてもう一回やり直すだけで、正直退屈だった。

新しい概念っつったらxが出てくることくらいか。それも、もともと鶴亀算が苦手だった俺としては、かえってありがたいくらいだったけどな。


むしろ強烈だったのは高一ギャップだ。

シグマだのサインコサインだの対数だの、具体的なイメージのつきにくい抽象的な概念が次から次へと出てきて、表面的な計算テクニックだけ教わっても、何それ、リンゴミカンで言えば今何してるの?って感じであっという間に最下位になった。


中学校の時あれだけ暇だったんだから、もっと中学校のうちにいろいろ教えてしまえばいいのにな。

そうすりゃ高校でわけわかんない概念が山ほど出てきたとき、もっと丁寧に教える時間が出来るのに。

ゆとり教育って、高校落ちこぼれを量産するための制度意味わかんねーよ。

2008-12-31

http://anond.hatelabo.jp/20081231110651

組み込みって言っても、最近は、ほとんど、マーベルシグマテル、なくてもARM系の亜種、大手家電メーカーの独自チップとほとんど決まり切ってるから、さすがにコンパイラが無いって事はほとんど無いんじゃないかと。

Cのコンパイラさえあれば、Perlでもなんでも、クロスコンパイルかければ済んじゃうし。

まぁ、速度でないだろうけど。

2008-12-07

http://anond.hatelabo.jp/20081207135024

いや、それはシグマコンパクトデジカメであって俺が言ってるのはこっち

http://dc.watch.impress.co.jp/cda/review/2005/06/30/1833.html

これと入門用一眼があればなんでもボケボケにはなるよ。

よくわからんけど、一眼のレンズっていうのは全社共通で使えるもんなの?

デジタル一眼と名のつくカメラとこのレンズがあれば無敵だってこと?

DP1は一眼よりはるかにめんどくさいからやめたほうがいい。

そうなのか。

今までずっとDP1のこと調べてたよ。

危うく買うところだった。

http://anond.hatelabo.jp/20081207134741

いや、それはシグマコンパクトデジカメであって俺が言ってるのはこっち

http://dc.watch.impress.co.jp/cda/review/2005/06/30/1833.html

これと入門用一眼があればなんでもボケボケにはなるよ。


DP1は一眼よりはるかにめんどくさいからやめたほうがいい。

http://anond.hatelabo.jp/20081207133149

ところが今は撮れちゃうんだな。

シグマかなんかの明るい単焦点レンズをつけてフルオートシャッター押すだけでアホみたいにソレっぽい写真がとれる。

シグマDP1って格好いいな。

Thinkpadみたいで好みだ。

この7万くらいのでダカフェみたいな写真撮れるんだったら許容範囲だ。

嫁は一眼レフじゃないとああいう写真は撮れないと思っているみたいだ。

http://anond.hatelabo.jp/20081207131509

なんかネットにその機種で撮った写真がいっぱい載ってるじゃないか。

あれが綺麗すぎるのが問題だと思うんだよな。

あんなうまく素人が撮れるわけないのに。

ところが今は撮れちゃうんだな。

シグマかなんかの明るい単焦点レンズをつけてフルオートシャッター押すだけでアホみたいにソレっぽい写真がとれる。

2008-07-11

Re: カメラ欲しいけど。

欲しい機能が良く分からないので、想像しながら書いてみる。

僕もむちゃくちゃ詳しいわけじゃないから、間違ってるとこがあったらえろいひと訂正よろしくね。



1.とにかく撮りたい。

この要望を満たすためだけなら、携帯電話カメラで十分だよ。

構図とか色々考えて撮ってみるだけでも楽しいよ。

ただ、一枚一枚撮るのに時間がかかっちゃうのが難点だね。


2.気軽にパシャパシャ撮りたい。

これは少なくともコンデジが必要だね。

散歩とかサイクリングしながら面白いものをパシャパシャするのは楽しいよ。

安いのでもいいと思うよ。


3.遠くのものを撮りたい。

ズーム機能が付いているものを買おう。

デジタルズームっていうのは無視していいよ。

光学ズームっていうほうの倍率をみようね。

10倍ズームくらいあると、電信柱の上のカラスをそこそこ大きく写せるかな。


4.接近して撮りたい。

接近して料理とか小物とか撮りたい場合は、仕様の撮影距離範囲とか撮影距離とかいうとこを見てみてね。

大抵○○cm??∞って書いてると思うんだけど、○○cmが小さい数字のほうがより近くで撮れるよ。

5cmくらいまでよれれば十分だと思うけど、1cmとかいうのもあるよ。


5.画質だろJK

デジイチを買おうね。

撮影に可能なことはほとんど何でもできるように作られているよ。

ただ、何でもできるようになるにはテクニックがいるのと何より交換レンズを数万??かけていくつか購入しないといけないよ。

分かってると思うけれど、一眼レフカメラレンズ別売りだからね。

セットのやつは「レンズキット」っていうのがあるよ。知ってたらごめんね。

カメラのこともレンズのことも調べるのが面倒なときはこれを買うといいかもね。

そうそう。無理して高いのを買わなくてもいいよ。エントリー機で十分。

実はレンズカメラがセットで3万円台??で買えるので探してみるのもいいかも。


6.画質も欲しくて撮影もこだわりたいけど重いのもヤダ。

我侭だね。でもそういうもんだよね。

デジイチにはちょっと画質は劣るけど、そう人向けのモデルもあるよ。誰かが言ってたネオ一眼とかもそうだね。

他にも有名なのでリコーGR DIGITAL IIとシグマのDP1という機種があって、画質がいいということになってるよ。

あ、でもこの2つには「光学ズーム」が付いていないからね。遠くのものはアップで撮れないよ。

それでね、画質ね。

「画質」がいいって曖昧な表現だから比較が難しいんだ。ただ、「画素数」は無視してもいいと思うよ。

特にブログに載せるなら100万画素あれば十分だよ。

カメラ屋さんで写真にしてもらうにしても600万画素あればいいと思うよ。

それより仕様の「CCD」(あるいはCMOS)のサイズをみてみようね。

1/○○って書いてるよね。それが撮像素子(アナログカメラフィルムに当たる部分)のサイズなんだ。

○○が「小さい」ほうが撮像素子のサイズが「大きい」んだよ。

そして、大きいほうが描写が豊かで画質が良いとされている(超簡単にいうとね)。

次にこだわりの撮影だけど、これは仕様の撮影モードみたいな欄をみてみようね。

キャンドルモード」「美肌モード」とかそういうのは無視していいかな。

シャッター速度優先モード」「絞り優先モード」「マニュアルモード」が付いているカメラがいいよ。

カメラとか写真の仕組みをほんのちょろっと勉強するだけで、好み撮り方ができるよ。

被写体深度が浅い写真が撮りたいな、とかね。分からなかったら無視していいよ。




こんな感じかな。

2008-02-26

http://anond.hatelabo.jp/20080226133347

> おまけで通話まで出来る!

(笑)

iPhoneメール書いてるところって、想像できないけど。

A-60(CASIOPEIA)と、初代シグマリオン??シグマリ2の頃は、良く使ったなぁ、

その後は、PDA買っても殆ど使わなくなってしまったけど。なんだか殆ど一通り今でも持ってる気がしますが。

2008-02-12

http://anond.hatelabo.jp/20080212225225

だからアルファブロガーなんだよ。そうでなければ、ただのベータブロガーじゃないか。目指すはシグマブロガーだけどな。

2007-05-31

次世代アイドル声優レビュー

意外と的確なまとめだと思った。スレタイはちょっとどうかと思うけど。

井上麻里奈平野綾水樹奈々を完全に超えた!!

http://anime2.2ch.net/test/read.cgi/voice/1178095164/


47 名前:声の出演名無しさん[] 投稿日:2007/05/03(木) 22:38:06 ID:ptO8JJZj0

ようつべPV見てきたが反則的なかわいさだな。

平野には貯金若さがあるが、水樹では分が悪すぎる。


次世代アイドル声優レビュー


井上麻里奈…ルックス、スタイルトップクラス。何故アニメ声優に?!

平野綾アイドル声優の模範のような活動を展開。アルバム、単独ライブなど新しい燃料がほしい。

小清水亜美アルバム発売からドル活動が空回り。嘘でも元気なあみすけが見たい。

藤田咲アーツを背負う宿命にある女。基本スペックは低くはないがライバルが強力すぎる。

名塚佳織…顔がいいだけに、もっとウザイくらいにアイドルしてもいいと思う。

酒井香奈子…消えそうで消えない絶妙な位置で今日ヲタの財布を狙う。

喜多村英梨…天運に恵まれている。実力もある。影が薄いと思うのは気のせいだ。きっと。

後藤沙織里…ご存じさおりん。今にも消えそう。持ち前の負けん気の強さはどうした?

明坂聡美…作品を売って己を売らず。かわいいだけに勿体無い。

高本めぐみシグマ堀江由衣。ドル活動が消極的すぎる。

中山恵里菜えんなちゃん。ターゲットは盟友平野のみ。しかし惑星は遥か彼方。

長谷川静香若さだけでは武器にならない。続けていればきっといいことがある。

松本彩乃アーツ秘密兵器はついに封印を施されてしまったのか?頑張って出て来い。

中田あすみ…元人気No.1子タレだったのは遠い昔。

2007-04-12

http://anond.hatelabo.jp/20070412110513

うお、そうなのか。ピントずれなのかなあ。うーん、前に持ってたときは、なんか全般的にそういう感じだったからピントずれって感じはしないんだけれども。まあデフォルトシグマレンズが駄目だったのかもしれないです。はじめからいいレンズを買えば問題ないのかも。

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